Die größte Attraktion der Region stellen natürlich die unzähligen Seen dar. Eine genaue Anzahl dieser ist unbekannt, aber es sollten ca. 3.000 sein. Masuren ist in erster Linie ein beliebtes Reiseziel für Segler und Windsurfer. Viele der Seen wurden miteinander verbunden, so dass man hier auch Strecken von über 100 Kilometer ablegen kann. Das mit 250 Kilometer Routenlänge europäische Spitzenrevier erstreckt sich vom Mauersee (Mamry) bis zum Spirdingsee (Sniardwy), und bietet 600 km² Fläche zum Segeln oder Windsurfen. Auch die Windbedingungen sind hier sehr günstig. Zur Verfügung der Wassersportler steht zudem gut entwickelte Infrastruktur mit vielen Liegeplätzen, kleinen Häfen, Bootsverleihen, Hütten und anderen Übernachtungsplätzen, wie Ferienhäusern, Ferienwohnungen, Appartements, Pensionen und privaten Gästezimmern. Die zwei wichtigsten Wassersport Zentren befinden sich in Nikolaiken (Mikolajki) und Lötzen (Gizycko). Populär sind aber auch andere Orte, wie Elk (Lyck), Mragowo (Sensburg), Ruciane-Nida, Szczytno (Ortelsburg) oder Wegorzewo (Angerburg).

 Die Segelsaison beginnt hier aber bereits mit dem ersten Eis. Die Region hat sich zunehmend auch auf das Eissegeln eingestellt. Die kalten und windigen Winter bieten nämlich beste Voraussetzungen für dieses unvergessliche Erlebnis. Bereits unerfahrene Eissegler können hier Geschwindigkeiten von 60-70 km/h erreichen und die Profis schaffen sogar das Doppelte. Für Anfänger stehen auch Eissegelnschulen zur Verfügung. Im Winter ist aber auch Skilanglauf, Eislaufen und Eisangeln hoch auf Touren.

Masuren ist auch ein populärer Ziel für Kajaktouren. Die Flüsse und Kanäle, die die zahlreichen Seen miteinander verbinden, bilden auch unzählige Strecken für Kanufahrten. Viele davon sind auch bestens für Anfänger geeignet, für die längsten davon braucht man mehrere Tage. Beliebtester Fluss ist die Krutynia, die sich Dutzende Kilometer langdurch eine parkartige Landschaft schlängt. Wer Lust auf eine völlig unberührte Natur hat, kann die 150 km lange expeditionsartige Strecke auf dem Biebrza Fluss ablegen.